倭寇进犯山东，登州卫指挥戚景通按兵不动，他的儿子戚继光非常不解，父亲为何不去抗击倭寇?
几个来自少林的行脚僧经过被倭寇洗劫过的梅家村，发现还有一个幸存的男孩小顺，小顺被带到了少林寺，与一个调皮的男孩小福一起落了发，小顺的法号为月空，小福法号月文。
十五年后。
月空和月文都已经长大成人，山东登州的戚继光也继承了父亲的职位，担负着抗击倭寇的重任。
在战场上，戚继光所向披靡，为了一举歼灭倭寇残敌，他没有向兵部禀报，便带领兵马闯入浙江，并冲撞了浙江总督万表，结果身陷囹圄。
当世名将俞大猷救下戚继光，目前，倭寇危害最严重的地方就是浙江，俞大猷希望戚继光与自己浙江一同抗倭。戚继光意气风发，重新披挂上阵，但当他到宁波卫履职的时候，才发现这里的情况糟糕得无法想象。
少林僧兵分集介绍 第二集此时，朝中主和派占了上风，左都御使胡宗宪将作为钦差大臣前来浙江，准备举行一场祭海大典，解除海禁。“市通则寇转为商，市禁商转为寇”，如果海禁解除，倭寇也将不攻自灭。
少林寺的小山方丈接到邀请前来观礼，月文动心了，他很想借这个机会回家看一看，可当月文回到徽州，才发现他的家在十五年前就搬走了。
月文失魂落魄地来到了宁波，他没有找到月空，却倒在了一心客栈的门口。来自山东的善良姑娘李若兰帮助了月文。
月文找到月空以后，发现月空也在宁波认识了一个漂亮女子秀子，而秀子是个日本人，她的随从也是日本少林僧兵分集介绍 第一武士——风语。
戚继光怀疑风语和秀子两人是倭寇的奸细，而月空认出了戚继光，他恨戚继光，在他的眼里，戚继光的父亲就是梅家村被灭的罪人，月空出手救下秀子和风语，但自己和月文却被戚继光抓进大牢。
风语闯入大牢，救出了月空和月文。
少林僧兵分集介绍 第三集祭海大典开始。人群中却突然冒出几名刺客，大典一片混乱。月空与月文阴差阳错救下胡宗宪。
秀子也在混乱中受了箭伤。月空为秀子疗伤，伤倒是不重，但是秀子声称自己还有一种奇怪的病，月空无能为力，他只能请小山方丈亲自为秀子医治，可小山已经离开宁波，返回了少林寺。
临走前，月文再次去找李若兰，他注意到李若兰一直没有笑脸，就问她整天冷着脸，是不是因为自己欠她钱。李若兰被逗笑了，这个笑容成了月文最甜蜜的记忆。
月文告诉李若兰其实他还没有受戒，并不是真正的僧人，但李若兰不想跟月文有太多的纠缠，她也是梅家村人，不过当年村子被洗劫后，她没有看到父亲的尸体，她坚信父亲还活着，十五年来，唯一支撑她活下去的就是寻找父亲。
面对大典上无辜死伤的百姓，本地的商人也是大善人汪直不仅请了最好的大夫来为伤者医疗，还捐助了不少财产让死者得到抚恤。
但随后汪直就去了海上，与他会面的是当朝权臣严嵩的儿子兵部侍郎严世蕃，原来这次刺杀行动是由他们两人一手策划的，而汪直就是倭寇的首领——五峰船主，通敌的就是主张海禁的严世蕃。严世蕃爱财，只有海禁，他才能获取最大的利益。深受儒家影响的汪直虽然拥有巨大的财富，但是学而优则仕，他想的是严世蕃能给他谋个一官半职，然后衣锦还乡，光宗耀祖。
戚继光追查破坏大典的内奸，他顺藤摸瓜，盯上了一心客栈。
少林僧兵分集介绍 第四集月空带秀子走在去少林寺的路上，一路上风语对秀子照顾有加，但秀子却毫不领情，在月空为秀子疗伤的时候她的心也被月空俘虏了。
月空很尴尬，也很迷惑。迷失的不止月空，月文迷得更厉害，月文看着月空背上的秀子，总不自觉想起李若兰。
夜晚，月空点起了篝火取暖。少林僧兵分集介绍 第二天，等他醒来时，突然发现秀子睡在了他的怀中，睡梦中的秀子，还带着甜甜的微笑。
风语再也无法忍受这样的局面，他不想看见月空，他与月空分道扬镳。
一心客栈终于有了动静，就在客栈老板娘孙海清带人与倭寇交易的时候，戚继光也尾随而至，他发现原来海清的哥哥就土倭的头目──孙海啸，而海清就是倭寇安插在宁波城的内奸。
戚继光突然出兵，收复了一个被倭寇占领多年的小岛，还解救了大量难民。李若兰在难民中间寻找着自己的父亲，尽管最后她并没有如愿，但在一定程度上缓解了她与戚继光的关系。
少林僧兵分集介绍 第五集戚继光的突袭虽然成功，但也暴露了浙江官兵战斗力低下的事实，戚继光希望建立一支新军。可俞大猷没有军费，身为少林俗家弟子的俞大猷准备亲自前去少林，请少林武僧下山，帮助戚继光训练军队。
月空和月文刚回到少林寺，就被罚面壁思过。
秀子甩开风语，独自来到少林寺，为了见到月空，秀子声称自己是月空的妻子，她的谎言在僧人中间引起了强烈的震动。
月空将事情的前因后果原原本本地告知了小山，可当小山为秀子把过脉之后，却发现秀子根本就没有病。
气愤的月空将秀子赶出少林寺，委屈的秀子只求他送自己一程，月空忍住怒气将秀子送了一程又一程，最后终于停下了。秀子给了月空一个选择，一个是要他还俗，另外一个是自己死，月空会选择哪个?
月空不语，秀子突然向着悬崖跳了下去。
少林僧兵分集介绍 第六集悬崖下面是个深潭。出家人慈悲为怀，救急扶危，月空不能见死不救。但他中计了，熟悉水性的秀子反而把月空缠在了水里。
当两人从深潭中爬出来的时候，正看到怒气冲冲的风语，风语一定要月空死在自己的刀下，他大闹少林寺，直到大脚僧出现，才用少林伏魔棍制服风语。
月文强烈要求与俞大猷下山抗倭，小山答应了月文。佛法在世间，不离世间觉，这不仅可以让月文更好地理解佛法，还可以救国救民。
海清突然收到命令，让她杀掉戚继光，就在海清计划时，宁波卫所的刘千户来了。刘千户对海清垂涎已久，当他对海清施行暴力的时候，戚继光不期而至。
少林僧兵分集介绍 第七集为了严肃军纪，戚继光杀了刘千户，此举完全扭转了海清对戚继光的态度，但刘千户是浙江总督万表的表弟，这为戚继光以后的抗倭带来了很多不利影响。
月空与月文在俞大猷的带领下来到了戚继光的军营，在士兵们的怂恿下，戚继光和月文进行了一场比试。
月文的功夫超过戚继光，但月文出手过于慈悲，反而被戚继光刺伤，本来与戚继光就有不少矛盾的月文更加愤怒，他一定要报这一枪之仇。
吏部的文书下达，汪直盼望已久的官职终于有了眉目，可等到宣布职位时，他大失所望，他仅仅被任命为布政司所属军器局中的副史，这几乎是一个可以让所有人忽略的职位。
汪直认定自己被严世蕃骗了，他立即安排养子毛海峰准备战斗，血洗宁波。
少林僧兵分集介绍 第八集戚继光检阅月空的训练成果，月空正从基本功教起，准备把手上的部队全部训练成武功高手，戚继光告诉月空战场上不是单打独斗，他让月空多学习一些兵法。
月文与戚继光再次发生矛盾。恼怒的月文为了报复，将戚继光的战马放掉，结果闹出大乱，戚继光决定将月文斩首示众。
在俞大猷的干涉下，戚继光放掉了月文，但月文却不愿意领戚继光的情，甘愿受罚五十军棍。
月文的棍伤刚好，训练时几个士兵又迟到了，戚继光当然不会放过违反军纪的士兵，但月空将所有的惩罚一个人承担了下来，此举让他赢得了士兵的爱戴。
为了与戚继光划清界线，月文决定建立僧兵，正式树起了少林僧兵的大旗。
少林僧兵分集介绍 第九集士兵们开始逃走，原来军饷被万表扣下了，戚继光非常愤怒，但又无可奈何，他知道这是万表对他杀刘千户的报复。在戚继光最困难的时候，俞大猷挪用军饷暂时帮他度过了难关。
戚继光设计了新的武器，交给军器局，身为军器局副使的汪直，答应帮助戚继光打造更好的武器，但因为军费无着结果仍然是竹篮打水一场空。
月文发现了一个既便宜又好用的新武器──毛竹，兴奋的戚继光利用毛竹设计了新的战术。
毛海峰指示海清摸清戚继光的战术计划，但海清故意拖延时间。毛海峰决定收买李若兰，李若兰有些矛盾，是放弃寻找父亲?还是出卖自己的军队?
犹豫再三，李若兰还是来到戚继光的军营。
少林僧兵分集介绍 第十集李若兰将戚继光的作战计划交给了倭寇，倭寇立即出兵，正式进攻宁波。
大兵压境之时，月文突然得到了父母的消息，原来他的父母就在苏州，他立即赶了过去，可是见到父母之后，他的希望之火再次被扑灭，父亲将他逐出了家门。
令人心悸的海螺声在城外响起，倭寇攻到了宁波。戚继光挥兵迎上，但面对气势汹汹的倭寇，戚继光很难抵挡，他临时改变计划，将自己的主力部队集合起来，准备擒贼擒王，然后各个击破，他将阻截倭寇救援部队的任务交给了月空。但临阵之时，月空看到了倭寇阵营中还夹杂着不少难民，他一时慈悲，却造成兵败的局面，僧兵损失惨重。
月文回来的时候，宁波已是一片废墟。
少林僧兵分集介绍 第十一集万表终于找到借口，将败军之将戚继光抓了起来。
月文内心充满绝望，他再次来到一心客栈，李若兰告诉月文，十五年来，几乎每个晚上她都会发现，白天所做的一切努力都是徒劳的，几乎每个晚上都会绝望，但是最后她还是坚持下来了，因为每天太阳出来的时候，就是一个新的开始，每一个新的开始就会有一个新的结果，在没有得到一个结果之前，她就会给自己一份希望。
李若兰陪着月文一起看日出，新的一天到来了，月文也重新树立了生活的信心。
为了救戚继光，俞大猷得罪了万表。俞大猷告诉戚继光，在这样恶劣的条件下抗倭，戚继光必须做出适当的改变。
少林僧兵分集介绍 第十二集山口大名从日本派来使臣，日本使臣与戚继光在一心客栈相遇，戚继光再次将怀疑的目光投向了海清。海清忍着委屈，答应戚继光帮他查出奸细，没想到却查出了李若兰。
戚继光要亲手杀掉李若兰，但月文却斥责戚继光没有感情。李若兰为了寻找家人，出卖自己，她这样做真的错了吗?矛盾的戚继光最后还是放下剑，转身走了出去，李若兰其实也很后悔，她恨自己出卖了良心，她无法面对月文，也无法面对戚继光，她逃开了。
海清安慰戚继光，戚继光不知道为什么，他看着海清，想的却是李若兰。但是对海清来说，能与戚继光坐在一起喝酒，本身就是一件值得兴奋的事。
少林僧兵分集介绍 第十三集戚继光喝醉后，留在了海清的房间。海清把对李若兰的了解告诉了戚继光，戚继光重新查找资料，终于发现了关于李若兰父亲李忠诚的一些新情况。十五年前，李忠诚是与一批抗倭军费一起失踪的。
军饷时有时无，僧兵不仅训练难以维持，生活也出现困难。月文去找汪直化缘，汪直隐隐约约地觉得月文似乎跟自己有某种关系。
军饷终于发放了，但同时也传来了一个不好的消息，俞大猷因为挪用军饷一事，被万表下了狱。
戚继光经过调查，发现一些证据。十五年前，梅家村遭受攻击的时候，父亲之所以没有出兵是得到了兵部的命令，他父亲不是罪人，真正有罪的是兵部通倭的官员。
少林僧兵分集介绍 第十四集戚继光自从喝醉以后，再也没有去过一心客栈，海清备好了酒菜，希望与戚继光叙旧，但是戚继光始终没有出现。
秀子的父亲其实是一本大名，风语跟随她来到大明，不仅负责保护她，同时还肩负着一本大名的重托，与大明王朝联合，大明王朝可以帮助一本大名统一日本，他也可以帮大明解决倭患。但是朝中无人难办事，秀子准备找月空帮忙。但是她不能让月空看见自己落魄的模样，她将身上所有的钱都拿了出来，做了一身漂亮衣服，赶到了僧兵训练场。
汪直也来了训练场，他将自己的侄子送过来参加僧兵，表面上是让他为国杀敌，事实上却是做自己的眼线。
毛海峰在帮李若兰找父亲的时候，发现了倭寇首领宫本的秘密，宫本已经严重威胁到了汪直的地位。
汪直决定借刀杀人，除掉宫本。
少林僧兵分集介绍 第十五集秀子病倒了。大雨中，风语抱着秀子赶向城中，他想抢一辆马车，却抢到了汪直的头上。不过汪直不仅没有责备风语，反而为了秀子请了最好的大夫。
汪直设下连环计，将宫本准备袭击徽州商队的消息报告了万表，万表亲自带领戚继光、月文、月空，准备打一个伏击。
战斗开始，万表命令戚继光进攻，却让月文、月空按兵不动，月文这才明白，万表是想借倭寇的刀杀掉戚继光。月文没有理会万表的命令，率队冲杀，救下戚继光，杀掉了宫本。通过此役，月文与戚继光的关系也大为改善。
宫本死后，汪直终于控制了整个列表山，他找到了李若兰的父亲李忠诚。
少林僧兵分集介绍 第十六集毛海峰将李若兰带去了列表山，李若兰见到了父亲，但李忠诚却不承认李若兰是自己的女儿。
列表山上，来了一个新的倭寇首领——佐佐木，他前来取代死去的宫本。汪直发现，他根本无力与山口对抗。
一个流浪武士带来消息，秀子这才知道，身在日本的父亲在跟山口大名的战斗中失败了，她现在是一本家族唯一幸存者。她终于明白父亲把自己送到中国的真正目的，父亲早就知道自己的命运，他唯一的希望就是秀子能活下来。
万表搜刮了不少民财，准备为严嵩祝寿，但祝寿的船队将会经过列表山，万表把护航的任务交给了戚继光。
少林僧兵分集介绍 第十七集戚继光缺乏准确的航海图，他决定亲自出海勘察。
毛海峰设置了一个圈套，准备让李若兰带着李忠诚逃离列表山，然后悄悄跟踪，就可以将李忠诚所有的秘密都挖出来，但戚继光的突然出现，打乱了他的计划。
而李忠诚也知道了李若兰为了寻找自己，出卖过戚继光，他怒斥李若兰。惭愧的李若兰知耻后勇，她引开追捕的倭寇，救下戚继光。
毛海峰的阴谋破产了，但李若兰还有利用的价值，他决定以李忠诚相要挟，让李若兰查探戚继光护航的计划。
李若兰再次充满矛盾，如果完不成任务，她有可能再也见不到父亲，但是如果为倭寇做奸细，大明军队可能全军覆没。在犹豫中，李若兰被送回了宁波。月文欣喜若狂，但是戚继光觉察到，李若兰的回来不同寻常。
风语与秀子在汪直的诱骗下，去了列表山。
少林僧兵分集介绍 第十八集在李若兰最矛盾的时候，月文给了李若兰信心。李若兰连夜为戚继光画出了航海图。
汪直收到了李若兰的消息，立即制定计划。战场定在了两个海岛的中间，那是船队的必经之路，只要占了有利位置，胜券就可以握在自己的手中。
为严嵩祝寿的船队出海了。等汪直动手的时候，才发现船上根本不是普通的衙差，而是少林僧兵，而戚继光在海岛上也早有埋伏。
一场惨烈的海战过后，倭寇受到重创。
战斗取得胜利，戚继光也向李若兰承诺，他一定会帮李若兰找到父亲。
但月文却没有一丝兴奋，仗虽然打胜了，但是自己的僧兵也受了不少损失，更让他愤怒的是，少林僧兵里居然有奸细。
少林僧兵分集介绍 第十九集海清得到消息，她的哥哥孙海啸死在了这次海战中。愤怒的海清冲进军营，将刀对准了戚继光。
戚继光没有反抗，他带着海清走过被倭寇毁灭的村庄和店铺，触目惊心的现实让海清也倍感痛苦，她只是失去了哥哥，可是倭寇的屠杀又使多少人家破人亡。戚继光告诉海清，如果怪罪的话，她应该怪倭寇，这一切的罪魁祸首都是倭寇。
汪直对李若兰恨之入骨，李若兰给他们提供的是假消息。毛海峰带人前去抓李若兰，但是他们遇到了月文，月文救下了李若兰，但自己却落入了毛海峰的手中。
月文被活埋了，但这时候汪直却确认了一件事，月文是自己的亲生儿子，他救下月文，将身受重伤的月文送回了军营。
毛海峰溜到了一心客栈，他落井下石，强暴了海清。
少林僧兵分集介绍 第二十集饱受屈辱的海清亲手毁了一心客栈，躲了起来。
月文养伤期间，大脚僧劝告他可以趁这个时间好好参禅，但是月文对参禅没有兴趣，他只想在这个时间好好地享受李若兰的照顾，反正他也不是一个真正的僧人。
这一切大脚僧都看在眼里，月文的红尘劫难未了，月空呢，是不是还在想着秀子呢?
在列表山的秀子遇到了佐佐木，她与佐佐木发生矛盾，风语击败了佐佐木，但佐佐木反而用阴险的招数击伤风语，在佐佐木要杀风语的时候，毛海峰阻止了。汪直需要风语，风语还有很大的利用价值。
风语见到了汪直，他很惊讶，原来五峰船主就是汪直，不过为了秀子，他还是放弃了尊严投靠了汪直。为达到目的，可以不择手段，这是他跟佐佐木和汪直学会的。
归国无期，报仇无门，风语又变了，秀子更加不安。
少林僧兵分集介绍 第二十一集军费无望，李若兰与月文决定亲自筹钱帮戚继光建立水师，月文再次找到了汪直。
汪直答应月文，组织富商捐款抗倭。同时还传来一个令人兴奋的消息，万表被解职了，戚继光扬眉吐气，他终于可以大展拳脚，全力抗倭了。
万表解职，汪直的机会也来了，他对浙江总督的位子有些想入非非。
汪直给月文讲了一个故事，二十二年前，贫困的汪直曾经与一个富家女子相爱，但由于门不当户不对遭到女方家庭的拒绝，而这女子已跟自己珠胎暗结。后来，女子随父母之命嫁了人，生下一个男孩。七年后，当汪直发了大财，回到家乡才发现他们已经搬了家，孩子也不知去向。
月文泪流满面。他这才知道，为什么他的父亲将他送到少林寺，这强烈的打击让月文非常迷茫，他突然间感到整个世界都崩塌了，这是真的吗?我到底是谁的儿子?我来自哪里?我到底是谁?
少林僧兵分集介绍 第二十二集发生在自己身上的事月文无法向任何人倾诉，这种事说出来只能让自己蒙羞让母亲再次受到侮辱。当月文冷静下来，他开始同情自己的母亲，母亲心中的苦又有谁能知道?
痛苦过后，月文还是承认了这个事实。汪直兴奋地领着月文回到徽州老家。多年来，月文终于再次感受到了家的温暖。他开始蓄法，准备继承父亲的事业。
胡宗宪被任命为新的浙江总督，消息传来，汪直彻底绝望了，不管严世蕃的初衷如何，结果他仍然受骗了。
汪直心灰意冷，他回到列表山，看到这个据点，汪直顿时心生豪气，列表山才是他的归宿，他决定从现在开始，用所有的力量对抗大明政府。
大战即将开始。汪直明白，这次战斗将会决定自己的命运，他绝不能失败，但是少林僧兵是一支危险的队伍。
汪直欺骗月文，让他把大脚僧引了出来。
少林僧兵分集介绍 第二十三集大脚僧中了埋伏，佐佐木与风语两大高手同时攻击，最致命的还有汪直的那一刀。月文没有想到亲生父亲居然利用他来刺杀抚养自己十五年的师父。月文哀求汪直，但是汪直将月文打晕在地。
当月空带着僧兵赶来的时候，大脚僧早已气绝。大脚僧的死给月空以沉重的打击。月空似乎着了魔，他发誓不惜一切手段，向杀害师父的凶手报仇。
藏在僧兵队伍的奸细离开了，他临走的时候，偷走了戚继光的作战计划。
月文醒来的时候，正躺在去列表山的大船上，月文扑向汪直，他想为师父报仇，可他最终还是松开了手，汪直毕竟是自己的父亲。
汪直当着月文杀死大脚僧的目的就是希望月文放弃幻想，他劝月文跟着自己，早晚他的基业都是月文的，而月文根本不想当什么少船主，他一跃跳入大海。
新的浙江总督胡宗宪到任了，俞大猷官复原职。这时候李若兰在海边找到了奄奄一息的月文。
少林僧兵分集介绍 第二十四集李若兰救醒了月文，但是月文谁也不想看见，他消失在黑暗中。
胡宗宪开始着手招抚汪直的行动，同时他命令俞大猷、戚继光做好开战的准备。汪直也打算利用谈判的机会除掉胡宗宪，为此他还购买了鸟铳和威力巨大的火炮──佛郎机，佛郎机足以将整个谈判地点炸成废墟。
戚继光让月空暗中保护胡宗宪，而月空却想利用这个机会刺杀汪直。局势瞬息万变，结果是双方都无法预料的，月空没有杀掉汪直，却阴差阳错毁掉了汪直的佛郎机。
尽管月空无意中救下胡宗宪，但是戚继光对月空一次次违反军令的行为还是无法容忍，月空离开了军营，脱离了僧兵部队，他现在唯一的目标就是报仇。
戚继光感受到了解火器的巨大威力，他也需要火器，俞大猷答应向兵部请求军费。
少林僧兵分集介绍 第二十五集月空四处寻找风语，他没有找到风语，却发现了一个专杀倭寇奸细的黑衣女侠。黑衣女侠破坏了很多倭寇在宁波的联络点，然后将缴获的物资悄悄送到戚继光的军营。
月空很诧异自己为什么找不到倭寇，而黑衣女侠可以。他追踪黑衣女侠，原来所谓的黑衣女侠就是海清，月空希望海清帮他找到风语，海清提醒月空，他可以利用秀子。
月空绑架了秀子，秀子既意外又高兴，高兴的是她终于可以与月空在一起了，意外的是月空采取了却是这种方式。
戚继光购买火器的计划被兵部拒绝了，他决定偷倭寇的火器，进行仿造。
少林僧兵分集介绍 第二十六集倭寇向宁波再次发起进攻，僧兵群龙无首，戚继光希望月空回来，但却遭到了拒绝，月空在等待风语，他要杀死风语。
战场上，倭寇的火器非常猛烈，戚继光的军队战败了，就在明军如潮水一样退去的时候，一群僧人出现了，小山方丈亲自带领三十少林棍僧逆流而上，救下了戚继光。
戚继光仿造的武器出现质量问题，就在他继续尝试的时候，收到了李若兰被抓走的消息。 毛海峰将李若兰带到李忠诚的面前，遭到了与她父亲一样的严刑拷打。
风语来了，但月空却再次败给了风语，月空痛恨自己的无能，他明明知道风语是杀大脚僧的凶手，却无能为力。
秀子将自己对风语刀法的了解全部告诉了月空，但月空再也不想拿起那条让他失望的铁棍。
少林僧兵分集介绍 第二十七集月空找到了月文，他痛打月文，甚至要杀死月文，但月文毫不在乎，如果要死，还有什么比死在自己的兄弟手里让人感到安慰的呢?
月空停下了手，他很痛苦，汪直是月文的父亲，可这不是月文的错。
月文独自坐着小船，赶向列表山，他要救回李若兰，赎清自己所有的罪过。月空看着渐渐消失在大海中的月文，满眼含泪，他知道，月文此行，将不会再回来。
果然，毛海峰对月文的到来非常怀疑，但汪直想感化月文，他放了李若兰，还重新安置了李忠诚。他不仅需要感化月文，也需要月文感化李若兰，如果李若兰成为自己的儿媳，那李忠诚的秘密理所当然也该透露出来了。
李若兰对月文认贼作父的行为非常愤怒，她拒绝接受月文。
少林僧兵分集介绍 第二十八集李若兰决定杀死月文，她将碗弄碎，从柱子上挖下一枚长钉。
被月空绑架的秀子缠上了月空，不胜其烦的月空赶秀子离开，秀子与他已经两不相欠，但秀子发现她与月空的感情不仅没有减少，反而越来越多。
月空经历过生死，终于明白生命的意义，秀子只是红尘中一颗美丽的泡沫，他决定重回军营。月空向小山跪下，请求重新受戒，秀子质问月空，为什么月文对她没有半点慈悲。
无缘大慈，同体大悲，小山开导月空，如果从心里真正地放下，就不该伤害任何一个人，当然也包括秀子。
当月空试图开导秀子的时候，秀子却失踪了。
月文与李若兰的婚礼如期举行，洞房内，李若兰将准备好的钉子刺向了月文的胸口。
少林僧兵分集介绍 第二十九集月文知道毛海峰还在监视自己，他假装强暴李若兰，却趁机告诉她，其实自己是来救她的，如果能顺利逃出列表山，他只能采取这种手段，李若兰终于明白了。
为了不引起毛海峰的怀疑，月文与李若兰躺在了一张床上，但是月文发现，现在他的心居然没有一丝混乱。
月文按照汪直的指示开始套取李忠诚的秘密，但是李忠诚不仅没有被打动，反而断绝了与李若兰的父女关系，十五年前他失去了女儿，现在是自己抛弃了女儿。
佐佐木向月文学习少林棍法，很快他就找到了少林棍法的破绽，月文更加迫切离开列表山，他与李若兰一边观察列表山的布防，一边找机会再次来到李忠诚的住处，悄悄告诉了李忠诚他们的行动计划。
这时候风语也回到了列表山，他也有了一个新计划。
少林僧兵分集介绍 第三十集戚继光找到了海清，他表白了自己的心迹，但海清已经无法接受戚继光。
月文终于找到了一个机会，准备带上李忠诚离开列表山，但他不知道自己所有的行动都在风语的监视下。
果然，在他们刚刚上船的时候，海螺号就响了起来，危急之时，月文挡住了毛海峰，毛海峰命令风语出手，但风语却要毛海峰答应一个条件，抓住李忠诚，要分给自己一半的钱。
毛海峰拒绝了风语，亲自带领众倭寇攻击月文，将月文的脚筋砍断。
重获自由的李忠诚说出了当年梅家村灭亡的真正秘密，十五年前，他押运一笔抗倭军费，却被兵部的官员通知了倭寇，为防止倭寇抢劫，他将船弄沉，躲进了梅家村，没想到却给这个村庄带来灭顶之灾。
戚继光打捞出沉船，有了资金，他开始在矿工和农民中招募兵源，并借鉴少林罗汉阵创造出了一个新阵法──鸳鸯阵，但此时，兵部却下令解散这支新军。
少林僧兵分集介绍 第三十一集胡宗宪顶住了兵部的压力，命令戚继光全力进攻列表山。
中秋节到了，戚继光故布迷阵，他将一些老弱病残留在了军营，自己却带领士兵悄悄向列表山连夜进发。
战斗打响，戚继光却突然发现月空居然不见了，原来月空脱离了僧兵，悄悄地迂回到了倭寇堡垒的中心，当他看到瘫痪的月文时，眼泪顿时流了出来。他背上月文冲了回去，但风语出现在了两人的面前，几个武士也发现了月空，风语突然出手，倒下了的却是那几个武士。
月文被月空救了出来，向来以大局为重的戚继光，这次没有惩罚违反军纪的月空，他也被少林僧兵亲如兄弟的情感打动了。
少林僧兵分集介绍 第三十二集月文跪在小山方丈的面前，请求小山为他受戒。
在三十棍僧的佛号中，小山准备亲自为月文剃度，这时候，李若兰赶来了，不管她如何哀求，月文的决心已经不能改变。李若兰终于明白，她喜欢的是一个无法拥有爱情的人。
月文与小山一起回了少林寺，临走前，月文将改进的少林棍法告诉了月空。
戚继光重新观察列表山，他确信，如果以少林僧兵为奇兵攻敌，将会给敌人出其不意的打击，他们将会赢得这场战斗的胜利，但是唯一让他犹豫的是，月空带领的僧兵很可能全军覆没。
月空找到了戚继光，他在救月文的时候发现了一个秘密，倭寇最坚固的堡垒中心也是汪直防守最薄弱的地方。尽管他的想法和戚继光的一模一样，戚继光还是不能答应月空，他希望找到一个两全其美的办法。
汪直给风语下了一个命令──刺杀戚继光。
少林僧兵分集介绍 第三十三集风语找到了刺杀戚继光的最好机会，但他却突然改变了决定，他看到了秀子，秀子也来到了战场上，她依然喜欢着月空。风语突然发现，这个世界对他最重要的不是权利，也不是忠诚，而是爱情。
风语要杀掉月空，但是他败了，不过当那伏魔的铁棍对准风语的时候，月空却停下来了，他杀的不该是风语的人，而是他的魔心，我佛普渡众生，而不是进行杀戮。
风语这一刻也突然大悟，他缓缓地坐下来，举起了手中的刀，他要死在大明，向大明人赎罪。
秀子抱着风语的尸体，躺在了小船上，望着渐渐消失在大海中的小船，月空不禁叹气，这一切似乎像梦一样，他们真的存在过吗?
给戚继光下决定的时间越来越少，当月空再次提出突袭的时候，戚继光没有拒绝，他只能用三十棍僧的生命换回一场胜利。
这时，俞大猷与胡宗宪也赶到了列表山。
少林僧兵分集介绍 第三十四集(大结局)戚继光对待胡宗宪与俞大猷的态度很不客气，他不希望有人干涉他的指挥，但是胡宗宪说，他今天只是一个普通百姓，而俞大猷也只是一个普通士兵。
但很快俞大猷就开始干涉戚继光了，让月空突袭无疑于送死，但是戚继光坚持了自己的决定，他别无选择，这就是战争。
倭寇大部队再次与戚继光交战，胡宗宪也亲自拿起了一把刀与俞大猷上了战场。但是令汪直奇怪的是，他居然没有看到少林僧兵，等他清醒过来的时候，月空已经带领三十棍僧出现在他的身后。
月空与三十棍僧完成了任务，他们不仅毁掉了倭寇的佛郎机，还炸毁了倭寇的堡垒。但是他们也全军覆没，他们的肉身化成了一阵烟，风一吹，不知去了何处。
多年以后，老年的戚继光来到少林寺，在埋放着少林僧兵骨灰的塔林里，想起月空和那三十棍僧，他不禁潸然泪下……(全剧终)
