1937年，日军悍然发动“七七事变”，抗日战争全面爆发。随着战事的不断升级，大量的重伤战士由于医疗条件不足，得不到及时救治而牺牲。
刚从英国留学回来的优秀外科医生五哥(林柄坤)，正在上海一家医院的手术台上紧张地救治病人。
五哥的家乡西门镇被瘟疫笼罩，恩师陈教师尽其所能控制病情，由于缺少药品无法有效地控制瘟疫的蔓延，情急之下，陈师母让水虎前往上海向五哥求助，五哥迅速带着药品赶回古城，疫情得到控制。
五哥与从小一起长大的恩纯、三妹重逢。恩纯有着坚定的革命信念，恩纯动员五哥加入革命队伍，五哥则表示只想一心从医。
断绝关系多年的大哥突然登门，遇到从上海归来的五哥。
在恩师的劝说下五哥摒弃前嫌回到林家为大嫂就诊，多年的误会终于消除。
军医分集介绍 第二集三妹经常协助恩纯印刷抗日传单，镇上传言郭家出了风流小姐，郭老爷听说后怒不可遏，擅自辞去了三妹的教师工作，将三妹关进阁楼，命郭明轩严加看管。
陈教师积劳成疾，心脏病突发与世长辞，临终前托付五哥好好照顾恩纯，五哥悲痛欲绝。三妹闻讯从家中逃出赶到灵前拜祭。郭老爷得知后，要打三妹，二妹上前阻拦，混乱之中二妹受伤。五哥给二妹治伤，二妹对五哥产生好感。
陈教师灵前恩纯向陈师娘坦言自己和三妹已经决定投身革命。
正准备启程返回上海的五哥突然收到一封电报。
电报中说上海医院被炸，五哥只好暂留古镇等待消息。
大嫂想趁这个空档为五哥娶妻。
军医分集介绍 第三集林家大嫂去郭家提亲，郭老爷一口拒绝，并表示要娶只能娶二妹。五哥说非三妹不娶。
新四军路过西门镇，三妹以死要挟要出门，郭老爷同意三妹在大妹的陪同下上街。
三妹在征兵处遇见五哥，要五哥一起参军，两人远走高飞。五哥却说他只想做一名救死扶伤的医生。三妹认为五哥懦弱，气冲冲的在征兵处自己报了名。
身着军装的三妹回到家，令全家万分震惊。郭父怒骂三妹和大妹，并强行将军装退了。
恩纯上郭家澄清和三妹的关系，与郭老爷发生激烈争执，郭老爷突发中风。
军医分集介绍 第四集郭父觉得自己身体愈来愈差，恰巧郭家亲戚来给三妹说亲，介绍的是一家军阀大户。
郭父想在临死前将三妹嫁给一个真正的大户。犹豫后答应将三妹许配给军阀大户做姨太太，三日后成亲。
婚期将近，三妹面临着重大的人生抉择。
三妹选择自己主宰命运，趁着雨夜逃离了这个封建家庭。
当天夜里恩纯也留书出走。
林家大嫂准备再次上郭家提亲，得到的却是三妹上吊身亡的噩耗。
郭老爷自觉愧对三妹在家中猝死，郭太太病倒，五哥在坟前悲痛欲绝。
郭家遭遇如此变故，郭太太为郭明轩娶亲冲喜。郭明轩娶了阿翠为妻。
五哥决定留在西门镇开办诊所，带着水虎赴上海采购药品。
军医分集介绍 第五集五哥在上海购买药品回西门镇途中，为救治伤兵差点耽误回程。
得知三妹死讯的军阀大户上门逼婚，用枪顶着郭太太要强娶二妹过门，情况万分紧急。
匆忙赶回西门镇的五哥和水虎推车撞翻了军阀的马匹，枪支走火，军阀受伤。五哥现场搭建手术台，救了军阀。为救二妹，五哥谎称自己是二妹的未婚夫，军阀感激五哥的救命之恩，放过了郭家。
郭家和林家热闹的张罗着五哥和二妹的婚事，在两家人的安排下五哥迎娶了二妹。
军医分集介绍 第六集婚后林郭两家都沉浸在喜悦当中。陈师娘看到恩纯的来信，得知三妹没死的消息，但是没有告诉五哥，不想五哥陷入苦恼之中。
夫妻二人忙碌着，为诊所开业做着准备。为了照顾郭家，五哥决定将诊所开在已关门的郭家布店。
五哥从二妹口中得知三妹的棺材是空的，郭家是为了掩盖家丑编造了三妹已死的事实，三妹究竟是死是活?
五哥带着疑问询问陈师娘，看到恩纯的来信，原来三妹真的没死，她和恩纯一起参加了新四军。
醉酒的五哥回到家，将消息告诉了二妹。
新四军的驻地，在党和领导的教育下三妹和恩纯已经从进步青年迅速的成长为优秀的新四军战士。
二妹为当初隐瞒事实心存愧疚。五哥也因此闷闷不乐。
军医分集介绍 第七集嗜酒如命的郭明轩，回家偷钱买酒，遭到了郭母的痛斥。
在二妹和水虎的帮助下，诊所顺利开业。看惯了中医的乡亲们并不接受五哥的西医诊所，生意惨淡。五哥成功的为船老大进行盲肠手术征服了乡亲。诊所的生意出现转机。
大妹的娃娃亲未婚夫因病去逝。
二妹怀孕生下女儿宝华，为了更好地照顾二妹，五哥决定将诊所关闭一个月。
新四军部队紧缺药品，三妹主动要求回到西门镇找药。
三妹回到家中，郭母不肯原谅她将她赶出家门。
三妹得知五哥与二妹结婚生子的事实，她不能释怀。
军医分集介绍 第八集五哥为三妹买了批药品，结果被国民政府把药品扣押。五哥让水虎到隔壁镇又买了批药品。
三妹带着药品依依不舍的告别了五哥。
三妹走后，国民政府以五哥私通共党为由封了五哥的诊所。
米店少东家潘万年上郭家向大妹提亲，郭太太欣然接受。大妹无奈的接受自己的命运。
国民党36师战败，撤至西门镇。并召集了镇上所有的医生救治伤员。
郭母让五哥和郭明轩代表郭家参加大妹的婚礼，并叮嘱郭明轩不能喝酒。婚礼上郭明轩却喝的大醉。
军医分集介绍 第九集伤亡惨重的36师征用了学堂做临时医院，镇上的医生看到重伤伤兵的惨状吓得晕了过去。陈师娘提醒五哥会做外科手术，张师长派人从婚礼上将五哥带回。
潘万年认为是五哥冲了他的喜事，痛打醉酒的郭明轩，并在新婚之夜对大妹大打出手，暴露了凶恶的本性。
五哥凭借自己的医术挽救着一个个伤兵的生命。长时间的手术，体力不支的五哥晕倒在手术台上。
醒来后的五哥，喝完二妹熬的汤，继续为伤兵治疗。由于五哥全力的救助稳定了即将涣散的军心，赢得了张师长的敬佩。恩纯受重伤，三妹悉心的照顾，三妹告诉恩纯五哥已经和二妹结婚的消息，恩纯大胆的向三妹表露了爱意。
张师长敬佩五哥的人品和医术，希望五哥加入自己的部队，五哥婉言谢绝。当张师长向五哥讲述了日军犯下的罪行时，五哥震惊，改变了决定，生平军医分集介绍 第一次穿上了军装。成为了一名军医。
军医分集介绍 第十集郭明轩去找大妹要酒喝，潘万年因此打了大妹，还上郭家闹事，二妹一怒之下，泼了潘万年一身脏水。
日军逼近，战事一触即发，林家大哥大嫂告别五哥回福建娘家避难。
张师长查出潘家米店私囤粮食，国难当头为正法纪，张师长准备枪毙潘老板。大妹得知后求五哥帮忙求情，张师长看在五哥的面子上决定不杀潘老板，潘老板却被吓死在刑场。潘万年因此对五哥怀恨在心，他认为是五哥见死不救，害死了他的父亲。
保卫古城的战斗即将打响之际，郭太太平静的闭上了眼睛。
战争开始，五哥不眠不休的为伤兵救治，二妹带着宝华一直照顾着五哥。
军医分集介绍 第十一集五哥一身是血地回到家中，把二妹吓坏了，上下看过之后才知道他并未受伤，都是伤兵的血。 军医分集介绍 第一场战役的胜利了使国军部队沉浸了一片享乐之中，官兵们尽情的喝酒享乐。张师长率官兵进行射击比赛，薛副官拄着拐也来参加比赛，但五哥无论别人怎么说就是不参加。国军官兵们在河里脱光了洗澡，岸边的女人们都吓得跑了，水虎和五哥在河边看，官兵开五哥玩笑，非想扒五哥衣服，五哥拼命不从，惹得张师长和官兵更是哈哈大笑。宝华生日，张师长亲自来送了厚礼。张师长抱着宝华说，他己接到命令，不久就要率部队开赴北方前线，并当着二妹面说，五哥如果舍不得妻子女儿，可以脱了军装留下不走。五哥彻夜不眠，二妹也不说话，谁都不去碰那个敏感的话题。 五哥惶惑地找陈师娘，说我这一介文弱书生，对于国家不过是沧海中的一滴小水珠，对于妻子和孩子却是头顶上的天。自己懦弱无能，只配开一家小诊所养家糊口，却要去做自己力所不能及的事情。师长说过古城在劫难逃，我应该留下来守护我的家人。陈师娘说，救一个人就等于救了全人类。五哥严肃地告诉二妹，已经决定随部队上前线，二妹跪了下来，哭着恳求他不要走，但五哥在战场上亲眼所见所闻，作为一名军医，必须走。二妹找陈师娘，请求他们让五哥留下来。于是陈师娘来探询五哥的意图，劝他留下，五哥郑重告诉他自己的决定。 五哥把自己的决定告诉了水虎，并征求他的意见，水虎立即表示愿意一起跟五哥随军。张师长再次要求五哥参军，五哥执拗的还是不肯参军。张师长劝说他，参了军，遇有不测，家属还能得到抚桖金不参军死了就算白死。五哥开始犹豫，二妹却坚决的把那身军装丢掉。告诉五哥，无论如何都要五哥活着回来!
军医分集介绍 第十二集五哥关了诊所，和水虎一起将药品、器材和私人文件全部装箱，把一些药品分发给穷人，叮嘱他们怎样保管和使用。五哥帮二妹干一切可以干的家务事，把一切损坏的家具用品全部修好。二妹明白五哥现在特别珍惜跟她们在一起的时光，他是把所有的爱都预先透支给了她们。早晨五哥准备出发了，他对二妹说会按时寄信寄钱，每个月起码有一封家书向她报平安，他的军饷除了给自己留两块钱零花其余全部寄回家。薛副官带着一辆大卡车装上五哥诊所的器械，然后来接五哥出发。水虎做为五哥的助手也跟着他一起上路，水官来为他们送行，答应日后会尽力照顾二妹和他的女儿。 五哥走后，二妹突然象变了一个人，性格异常坚强起来，处事果断，言语干脆，家里的事全都一人承担起来，她唯一的信念就是盼着五哥从战场上早日回来。一路上路上，五哥和薛副官看着战争留下的处处痕迹，国军零散的部队，感受到危险越来越近。薛副官带着五哥到达了槐杨镇，张师长为五哥建起了卫生所，张师长请五哥来一起喝酒为他接风，但是他发现喝的白酒兑水了，顿时火冒三丈，提着枪找酒商算帐去了……
军医分集介绍 第十三集五哥早起到野外去采草药。碰到了穿着张师长军装，骑着张师长的马的苗凤。五哥一下被这战争中女色的美艳惊呆了。苗凤见五哥痴痴地看着自己，问他是谁，然后让五哥将阵地前的一束小黄花采给她，五哥立即照办了。苗凤嗅着小黄花香气，款款骑着马离去了。 薛副官告诫五哥，师长的女人千万不要走近。五哥告诉薛副官，师长在偷吸止疼用的可卡因，薛副官让他不要多管闲事。张师长索性脱了军装，穿上当地老乡的土布衣服，每天泡在小寡妇身旁不理队伍，苗凤卖酒他收钱，官兵们纷纷排队买酒给小寡妇和师长捧场。国军以胜军姿态处处花天酒地，寻欢作乐，没人训练管理军队。官兵们在河水尽兴嘻闹，张师长和苗凤并排骑着马在岸上边看边笑，风情万种。 五哥将一封信和自己的全部薪饷都寄回家里去。 二妹忙着应酬来做衣服的客人，水官背着宝华来看她，二妹非常感激水官对她和女儿体贴入微和照顾。这时，邮局送来了五哥的汇款单，二妹让水官帮着看着店，高兴地跑去了邮局。 潘万年又重新开起了一家小米店，他虽然好吃好穿地待着大妹，但稍有不顺心就拿大妹出气。 二妹收到五哥寄来的钱，贪婪地看着五哥写来的信，水官在一旁哄着宝华，分享着她的快乐。这时大妹赌气又跑来和二妹斥苦，见五哥来信了，大妹欣喜地研墨书写，忙着帮二妹给五哥回信。二妹在小油灯旁忙着针线活，凭口说几句话，大妹就借题发挥写出长篇大论。二妹看后笑着还是决定自己写。 由于卫生所里的药品不足，五哥上山采草药。站岗的哨兵过于紧张，以为是日军，向五哥开了一枪。
军医分集介绍 第十四集子弹穿过五哥腋下的衣服，但五哥竟然毫发未损，张师长要当众枪毙了开枪的士兵，五哥上前却拼命为他说情才让他免于一死，由此官兵们更加爱戴五哥。 张师长为了安全不许五哥再上山，决定让他到省城采购一批药品，并批准他可以顺道回古城看一眼家人。但是时间紧一天也不能耽搁。 正当宝华生病发着高烧，二妹和水官焦急地守在一旁，五哥和水虎风尘尘朴朴地进了家门，女儿高烧说着胡话，根本不认识五哥。薛副官给五哥探家的时间只有半个小时。他连忙给她打针吃药，只剩下十分钟，五哥流着泪抱着女儿亲了几下，把一些钱塞进二妹手里，然后冲到院里没命劈柴，劈好一堆柴后，向二妹嘱咐了三句话，又风一样地离开了家。 二妹跑出家门看着五哥远去了汽车，这才发现，她居然没来得及跟五哥说上一句话。她对水官说，她忽然有一种非常不好的感觉，这好象是她和五哥见的最后一面。路上，五哥泪流满面地陷入极度自责当中。桥被炸断，只好坐船渡河，然后换牛车继续前行。处处道路被封锁，几经辗转，终于带着药品回到师部。 张师长根据命令和作战形势，知道此仗凶多吉少，便将自己的一个小皮箱交给五哥保管，说如果他阵亡了，让他把这个皮箱交给苗凤养活后半生……
军医分集介绍 第十五集薛副官带着五哥来到阵地上，这里已经开始了一场白刃战，国军和日军在惨烈地拼刺刀。薛副官提着手枪，不时击毙冲来了日本士兵，拉着五哥去找师长。当薛副官和五哥来到这里时，张师长正向苗凤和水虎大发脾气，大骂他们，并用手枪逼着五哥和水虎带着苗凤下山逃命。 当五哥和水虎拉着苗凤跑下山坡，眼看着山头上的张师长和薛副官中弹倒地，山头被日本人占领。随后另一山头上吹响了军号，一支新四军从山上冲下来，和一些零散的国军一起加入到对日军的刺刀战之中。 水虎连喊叫地拉着五哥和苗凤跳进一条战壕里，随即不时有国军、日军和新四军士兵阵亡的尸体掉下战壕来，吓得苗凤惊叫不己。一个国军军官把一支枪塞到五哥手中，强迫他参加战斗。这违反五哥军医不参加战斗的原则，于是他选择对准枯树开枪。军官大声提醒他要向敌人开枪。这时，一枚手榴弹掉在他们身旁，五哥上前扑倒了苗凤，自己则中弹倒地。苗凤一看五哥死了，吓得连忙向山下跑去。水虎背着五哥艰难地在战壕中从尸体上向远处爬去。 二妹看到一个邻居大嫂接到丈夫死亡通知书，当街哭得死去活来，顿时心有不祥之兆。回到家，见一个邮差站家门口，二妹当时傻愣愣地站在那里不敢上前问。邮差上前递给二妹一封信，是她写给五哥退回来的，说五哥部队驻防的地方现在已经是日占区了……
军医分集介绍 第十六集乡间的路上，几名新四军战士和水虎带着一辆破的牛车行进了泥泞的路上，天上下着雨，车上躺着人事不省的五哥。水虎不时探着五哥的鼻息，将一切可能的为遮雨的东西都盖在五哥身上。车上还带着张师长托五哥转给小寡妇的小皮箱。 五哥被抬进卫生所的床上，五哥在喝了一口热水之后睁开了眼，他惊异地看到，站在他床上注视着他的新四军女干部是三妹。五哥从水虎口中得知，他们是被新四军救下来的。由于新四军没有医生，无法给五哥做手术，三妹紧紧握着五哥的手问他，能不能告诉她怎么做手术，她来给五哥做。于是五哥开始指导三妹和水虎给自己动手术，几次疼晕过去又醒来，水虎和一个战士按着他，三妹按照五哥颤抖的指示终于完成了手术，取出了五哥身上的三块弹片，五哥再也没力气了，睡着了，三妹也累得瘫倒在地。 战事又起，部队开始转移，五哥拖着受伤的身子坐在牛车跟着新四军转移。路上，三妹告诉他，自己已经和恩纯结婚了，恩纯现在是团政委，部队就在附近，晚上就可以和恩纯所在部队汇合了。 江平镇，三妹所在新四军部队与另一支部队汇合，刚驻扎下来，骑着洋马的恩纯带着警卫员就匆匆赶来了，说团长负伤了，肚子被炸弹炸开了膛，团里没有人能做这种手术，要五哥立即去给团长做手术。 五哥拖着受伤的身体为团长做了手术。他见还有很多等待救治的伤员，有新四军，有日军，还有国军。五哥毫无犹豫地开始为他们救治。筋疲力尽的五哥昏倒在手术台前恩纯看见五哥的国民党军装很扎眼，拿身衣服让他换掉。
军医分集介绍 第十七集五哥在给新四军救治伤员的时候，遇到了一批从前线运下来的日本战俘伤员，其中一个日本兵奄奄一息，五哥不顾大家的反对坚持对他进行抢救，义愤填膺的新四军连长用枪对准了五哥的脑袋也没能动摇五哥救人的信念。日本兵被救活了，可是混乱中，一名日本军官战俘偷偷藏起一把手术刀，趁机刺死了被五哥救活的日本兵，五哥受到刺激，拿起枪对准日本军官，可是令他意想不到的是，日本军官竟然是五哥留学的医学院同窗同学——竹野浩。满脑子军国思想的竹野浩不容许自己的士兵这样“屈辱”的活着，所以击毙了他。五哥斥责他的冷血。质问他难道忘了当年在医学院的誓言，忘了当年两人踌躇满志仁者仁心的理想。看着被打残手的竹野浩，五哥放下了枪：你的手没了，心没了，已经跟死人没有区别了。竹野浩看着五哥失落的背影咬舌自尽。 三妹和恩纯就五哥参加新四军的问题产生分歧。恩纯因为五哥参加过国民军和救治日本人心里不能释怀。可三妹认为部队需要五哥这样的医生。 恩纯和三妹给五哥送来新四军军装。五哥还像往常一样，治病救人可以，参加什么党派军队就算了。恩纯忍不住暴怒：我们不缺军医!我们需要的是跟我们有同样信仰、可以与我们同浴血，共奋战的战友!兄弟!……
军医分集介绍 第十八集五哥和水虎发现回古城西门的路己被封锁，两人只能决定先到上海，然后再从水路回西门古城。路上百姓觉得五哥和水虎形迹可疑，立即报告了政府，两人被当成日本特务抓了起来，被审问的过程中，幸亏一个当时的干事五哥给他看过病，心存感激，出来证明了五哥的身份，镇政府的人没再追究他们。 五哥和水虎听从了那个干事的劝告，五哥脸上抹上菜汁，化妆成病人，水虎是送他回家的伙计，两人才上了路，并不断发愁，躲得过今天躲不过明天，不知今生还能不能回到老家西门古城。 水官病了孤零零地一个人躺在床上打百子，浑身颤抖，二妹让他坐起来，用厚被把他包起来，然后喂他热汤喝。水官可怜地问二妹，如果五哥真的回不来了，二妹能不能跟了他。二妹坚决地说不可能，水官是叔叔辈的，如果五哥真的回不来了，她就当叔叔给他养老送终。水官流着泪喝着汤。 郭家大少爷郭明轩在烟馆认识一个地主，地主说他姐夫在重庆当大官，想在当地找个好人家送去给他姐夫做童养媳，开价四块大洋。郭明轩把这事告诉了媳妇，媳妇说宝华长得漂亮，又是大户人家，反正现在世道乱，活一天算一天，不如悄悄把宝华卖了。郭明轩头脑发晕，竟然听从了媳妇的话来找宝华，发现宝华自己在玩，就骗宝华说她妈要给她做新衣服。宝华爱美，高兴地跟他走了。郭明轩把宝华交给地主，地主一看很满意，当场给了钱，把宝华塞进轿子拉走了。 二妹不见了宝华，立即上街去找。二妹找到陈师娘，陈师娘也没有看到宝华。陈师娘在酒家找到郭明轩，问起看没看见宝华，郭明轩良心发现，哭着说对不起二姐，在陈师娘质问下说出真情。郭明轩带着陈师娘找到宝华，陈师娘当场掏出四块大洋，从地主手上救回宝华……
军医分集介绍 第十九集五哥和水虎乘坐长途车赶路，遇上强盗打劫，五哥装病，水虎则使出浑身解数表演没钱给哥哥治病，花点小钱避过劫难。 在经过某城镇关卡时，五哥和水虎因为没有良民证，被日军抓走。押送的路上，水虎偷偷用两块张师长留下小金块买通了日本兵，救了二人的命，赶紧落荒逃生。 一身破破烂烂的五哥和水虎终于来到上海码头，但他们失望地发现水路也被封锁了，没有回古城的船了。两人决定先暂时找个地方住下来再想办法。 五哥和水虎看到一个卖包子的脏女人正在和一个顾客吵架，满口脏话，泼悍无比。五哥惊异地发现这个女人原来是槐杨镇的小寡妇苗凤，但她早己没有了往日的风韵和温柔。五哥上前相认，苗凤万分惊讶之中终于也认出了他。苗凤见他们也逃荒来此，就说把他们接到自己家里先住下。苗凤带着五哥和水虎来到上海最下层的弄堂里的一间小阁楼里住下，发现家里还有一个正在生病的小男孩，苗凤说是张师长的骨肉，得了肺炎，但苗凤根本无钱给他治病。五哥拿出张师长要他保管的小皮箱，将里面剩下的小金块全部给了她，苗凤哭了，在这种人人难以自保的战乱年代，居然还有五哥这样金子般的心……
军医分集介绍 第二十集水虎在码头上找到一份装卸货物的工，平时干完活就睡在工房里。五哥找到他旧日同事，也得到了一个医生的职务，重新开始上班工作。五哥不让苗凤去卖包子了，专心在家里做饭照顾孩子，自己下班后带回鱼肉菜，三人象一家一样坐在小桌前吃饭，两人尽量回避五哥要回西门古城的事。 码头上水虎碰上一条运私货的船，几天后启航，船路过西门古城，船老大答应他们可以搭船顺路回古城。水虎兴奋地跑来给五哥送信，告诉五哥明天傍晚可以搭上一条回古城货船，要他做好准备，傍晚码头上见。 五哥把要回西门古城的消息告诉了苗凤，五哥想到不久就可以见到二妹和女儿，兴奋得哭了。苗凤也在一旁陪他哭，她的眼泪是因为将永远失去世上最好的一个男人。 五哥躺在床上，苗凤夜里流着泪半裸着来到五哥床边，但五哥望着天花板直挺挺在躺着，一动不动，苗凤流着泪求他，能不能和她们母子俩照一张合影，将来等孩子长大了，告诉他这就是他爸爸……
军医分集介绍 第二十一集二妹在锅台前做着饭，水官教宝华念书识字，黑瘦的五哥一下闯进门来，二妹和水官都象见到鬼一样。用不了多久也会找机会回古城。但女儿宝华已经不认识五哥是谁了，五哥无比怜爱地抱着女儿哭了。 五哥告诉了水官他儿子水虎还在上海，水官看着二妹激动的样子，情绪低落地走了，水官喝醉了酒，把自家的渡船砸个洞，沉入水底。 五哥来看望陈师娘，告诉他们恩纯和三妹的情况，陈师娘听后十分欣慰。 二妹来告诉大妹五哥回来了，大妹凭想象开始编故事，断定五哥在上海另有一个家，是五哥在上海读书时一个为五哥从良的风尘女子，她带着孩子情愿为五哥守节一辈子。但二妹不信她编的故事。 五哥离开古城后这里开了一家医院，五哥家里已经很穷了，便来应职，院长听说过五哥高超的医术，便高兴地收下了他。 一个危急病人没钱治病，妻子带着三个孩子跪在医院门厅磕头，五哥做主给病人施行抢救。病人救活了，但是五哥才上班几天的班就却被解职了。 五哥把诊所打扫干净，但这里除了几间房子已经什么都没有了，他想把诊所重新开起来，但苦于家里一点钱也没有，根本买不起医疗器械和药品。一个没钱的穷人上门来找五哥看病，五哥见他饿晕了，便让二妹去弄点米汤，二妹没有去。病人走后五哥生她的气，说二妹以前的善良没有，但二妹打开米缸后五哥才知道，家里已经穷得根本没有米了。五哥把当年在上海当医生时买的一个瑞士手表交给二妹，让她卖了补家计，但二妹坚持不同意，称这块表是五哥的护身符。 五哥为了维持家计，干脆帮助二妹一起做衣服，五哥用他那双灵巧的医生的手缝出来的衣服让二妹刮目相看。五哥对女儿也越发疼爱，给她洗脸梳头发，把刚煮好的牛奶吹凉，把熟鸡蛋切成小块喂到她嘴里。 潘万年和大妹说，西门街头传说从北方来的共产党军队已经到了古岭，蓄势待发准备攻打古城，血腥巷战要打到家门口。胆小保守的市民们开始抢购粮食，食物和水。潘万年借机提高米价。大妹劝他不要再屯积粮食，他爹就是这么死，潘万年生气又打了大妹……
军医分集介绍 第二十二集二妹患了“嗜睡症”的怪病，开始昼夜不分地昏睡起来，仿佛是一部长年超负荷运载的机器刹那间里散架了。不知道自己怎么从厅堂睡到卧房里，不记得中间醒来过几次，只记得绵长温柔的梦，梦见父亲，像抱幼孩子那样抱起她放在双膝上。 在陈师娘的帮助下，五哥的诊所重新开了起来，并且增加了一些病床，买够了急救药品和手术器械。 五哥默默担负起全部家务，下厨房学会了烧火做饭，洗衣打扫卫生，包括带孩子辅导功课。晚上当五哥困得闭着眼给宝华讲小人书时，窗外响起了枪炮声，五哥让宝华和二妹睡在一起，自己立即出门了。 五哥找到陈师娘，陈师娘兴奋地告诉他，山上的新四军已经开始向汪精卫的日伪守军发动进攻了，要五哥马上去诊所，自己出去接应一下。 五哥站在窗前，看到新四军的部队顺利地冲进了城，街上日伪守军只进行了轻微巷战抵抗便弃甲而逃。随后，陈师娘带着几个新四军伤员进了诊所，五哥立即为他们进行救治。 二妹依然沉睡着，宝华守在一旁看书。郭大少爷拿着来酒瓶跑来把二姐叫起来，告诉她古城解放了，酒又变回原来的味了。二妹说她从解放前一觉睡到解放后。 新四军收复了失地，三妹跟随一支新四军部队正式进驻古城。大妹和二妹上街新四军部队的入城式，恩纯和三妹穿着军服出现在队伍中，三姐妹多年后又重逢了。 恩纯带着三妹回到见父母，陈师娘看着三妹非常高兴。 五哥依然帮着救治伤员，三妹悄悄走到他身后。三妹告诉他，恩纯和她一起回来了，让想他们一家一起来吃顿团圆饭。 五哥和二妹带着宝华和陈家人一起吃饭。当年五哥和三妹孩子时初时的地方，三妹动员五哥参加新四军，正式成为共产党部队的一员。五哥答应认真考虑。 五哥征求二妹意见，二妹说你当兵九死一生，还没当够吗。五哥说是共产党队伍救了他的命，必须报答。二妹叹息一声说，你想好的事就决定吧，不要跟我商量了。看着二妹失落的神情。五哥选择留在二妹身边好好过日子，婉言拒绝了三妹。 郭家鼓楼成了新四军的团部，三妹和恩纯又为五哥正式参加新四军的事大吵了一架，最后恩纯赌气说让三妹看着办……
军医分集介绍 第二十三集恩纯收到举报信，说五哥历史不清白。恩纯为正视听，只能暂时扣押了五哥，停了他的职。二妹三妹为五哥抱不平，五哥自己倒是心态平和，开玩笑自嘲：自己就不是参军的命。
三妹一直以为是恩纯对五哥有成见才这么“整”五哥。直到她无意中听到恩纯跟党代表发脾气，用脑袋担保五哥的清白，才彻底明白恩纯的苦心，明白自己的丈夫是个心胸坦荡的人。
五哥的问题还没查清，日本鬼子又打进了西门镇，恩纯带领新四军奋起反抗，终寡不敌众率军撤退。三妹在战斗中受了重伤，被水官救起背回二妹家。 鬼子进了西门镇，开始烧杀掳掠。五哥和二妹将三妹偷偷藏起疗伤。潘万年当了汉奸，在西门镇横行霸道。鬼子搞亲善政策，让陈师娘的学校教孩子日语，陈师娘宁愿关了学堂，也不答应教日语。潘万年告诉日本人陈恩纯是共党。鬼子把陈师娘拉到镇广场示众，杀一儆百。五哥悲愤不已。在杀害陈师娘时，日本军官被打了黑枪，虽没致命但日本人坚信，有共党还藏在西门镇，下令进行地毯式搜索。五哥正犯愁怎么将三妹转移出去，水虎找上门来……
军医分集介绍 第二十四集潘万年无意之中听到三妹还在西门镇，而且当晚要逃走的消息，很是兴奋，要去日本人那里告密领赏，大妹阻拦，争执中，大妹得之原来当初向新四军告发五哥的匿名信也是潘万年写的，义愤中大妹一枪打死了打了他一辈子的潘万年。在水虎的帮助下，五哥和三妹在鬼子眼皮底下安全转移。
临分别，三妹为安全考虑劝五哥跟他们一起走，五哥不能丢下二妹，毅然决定回去。
二妹被日本人关起来，质问五哥的下落。二妹不说。日本人又把郭家老少都抓了起来。郭太太心脏病发作当场毙命。鬼子丧心病狂当着喝醉的郭明轩的面糟蹋了已经疯癫的阿翠。 五哥回来。日本人却露出和善的嘴脸。不但放了二妹，还把五哥当成座上宾。原来日本人听说了五哥人造血的特殊技能，要五哥为大日本皇军效力。而且还为五哥把诊所重新开张，庆祝……
军医分集介绍 第二十五集(大结局)五哥宁愿自残手臂也坚决不给日本人效力。日本人恼怒，为了引出共党，一石二鸟，日本人放言要杀了五哥。
五哥临刑前，三妹带着水虎前来营救，为了保护五哥三妹牺牲。临死前，三妹把胭脂盒还给五哥……
杀害三妹的日本军官身受重伤，日本军医没有办法帮他取出子弹。日本人要五哥给做手术。只要做了这个手术五哥就自由了，否则就杀了二妹。二妹为了不拖累五哥，自尽身亡。万念俱灰倍受摧残打击的五哥答应了日本人的要求。
手术台上，五哥镇静的做完了手术，日本军医在一边露出欣赏的目光。监视完成手术的军官对五哥很满意。五哥：医生该做的我做完了。该做一个中国人该做的事了!!说着掏出了手术台上日本军官的枪……
战火纷飞的战场，冲锋号想起，几个士兵呼喊着一个受伤的人：连长!连长!卫生员!……看不清连长的脸，但一边掉落了一个胭脂盒……(全剧终)
