第一次入棺:1908年死后第二天慈禧被殓入棺
光绪三十四年(1908年)十月二十二日未时三刻，慈禧走完了她74年的人生路程，撒手人寰。当天下午4时30分，掌仪司首领太监用鹅黄吉祥轿将慈禧的遗体从西苑仪銮殿抬出，5时15分到皇极殿，放在回床上。
第二天上午8时5分，在隆裕皇太后和瑾妃的敬视下，慈禧的遗体被殓入了棺内。宣统元年(1909年)十月初四日巳时，慈禧的梓宫葬入菩陀峪定东陵地宫。
第二次入棺:1928年遭盗墓抛尸全身长满白毛
慈禧死后20年，即1928年7月4日至10日。军阀孙殿英盗掘了乾隆帝的裕陵和慈禧陵，毁棺抛尸，掠走了全部随葬珍宝。慈禧遗体被抛出棺外，嘴里的宝珠被抠走，上衣也被扒光了，下体仅剩一条内裤。
盗案发生后，溥仪派载泽、耆龄、宝熙等人到东陵对慈禧的遗体进行了重新安葬。载泽等人钻进地宫，见慈禧遗体趴在棺盖上，头朝北，脚朝南，左手反搭在后背上。在地宫里已暴尸40多天，遗体上出现了许多斑点，长满了白毛。
开启慈禧内棺，日期定在1983年12月6日下午下班后没有游人之时。为清理慈禧内棺，清东陵文物保管所组成了一个由所长宁玉福带头的13人清理小组。
慈禧内棺通体朱漆，顶部四面收起，呈坡状。棺长225厘米，前高98厘米、后高91厘米，前宽128.5厘米、后宽123厘米。四壁内外均阴刻藏文佛经，填以金漆。棺盖上有9尊团佛像和凤戏牡丹图案。整个内棺基本完好。开启棺盖后，只见一件黄缎大被把棺内盖得严严实实，被上盖着一件黄缎袍，袍上又盖一件坎肩……显而易见，这是1928年溥仪派人重殓后的原状!
第三次入棺:1984年文物局清理内棺搬出尸体
宁玉福当即决定：不准接触棺内之物，立即盖上棺盖，恢复原状。几位领导连夜开会，做出两项决定：将开启慈禧内棺一事迅速上报省和国家文物局;暂时关闭慈禧陵地宫。
12月8日，副所长于善浦带着材料进京，向国家文物局汇报;副所长谢久增则前往石家庄，向河北省文物处汇报。
1984年1月4日，国家文物局派5人来到清东陵。第二天早饭后，清理小组成员及相关人员进入慈禧陵地宫。我们每个人都穿着白大褂，戴着白口罩、白手套，一切行动都在摄像机的镜头下进行。
开启棺盖后，看到的仍是上次开棺时的情景。在专家的指导下，我小心翼翼地依次揭取了蓝缎坎肩和黄缎袍。每次揭取前，都要拍照片，量尺寸。揭开黄缎袍后，在黄缎被的上面发现一个黄绸子小包。我左手托着小包，用右手慢慢打开，里面是慈禧生前掉的一颗牙齿、剪下的二节指甲。这个小包是1928年溥仪派大臣重殓慈禧时所包。
慈禧遗体三次入殓之谜慈禧遗体保存得比较完整。她头朝北，脚朝南，仰身直卧。脸和遗体的上身被黄绸子包裹着。下身穿着裤子，上面绣满“寿”字，每个字长7厘米，宽6厘米。两只脚上也裹着黄绸。揭开黄绸，只见两脚被一条紫红色捆着，右脚穿着白绫袜子，左脚赤裸，袜子放在左裤腿上。揭开脸及上身的黄绸子，遗体的真面目展现了出来。
她的头微向左偏，两眼深陷成洞。有些花白的头发一部分披散于胸前，一部分顺垂于右侧。右手搭放在腹部，左手自然垂于左胯外侧，腰间扎着一条丝带，胸部袒露。虽然肌肉无存，遗体上还有许多裂口，但全身仍然皮骨相连。我用钢卷尺量遗体，全长153厘米。以此推断，慈禧生前身高当不低于160厘米。
遗体下面铺着一件黄绸里蟒缎褥。褥子下面是一块长条木板——如意板。这是当年抬遗体用的。我们就是用这块木板又将慈禧遗体抬出棺外。国家文物局的一名专家往棺内喷洒了防腐消毒药液，然后将慈禧的遗体又抬进了棺内，我将取出之物按原样依次放回棺内，恢复了原状。再次往棺内喷洒药液后，盖上了棺盖。这时木工已将残破的外椁维修好，随即将椁盖盖上。清理工作整整进行了一天。
