新警员常保乐刚到重案六组报到就接到一个任务，去迪厅清查三陪，他丝毫不知自己成了重案六组一次重要行动中的关键因素……
杨震打入带有黑社会性质的吴军犯罪团伙化妆侦察，在即将打入犯罪集团最高层时，突然遇到他的警校同学古阳，此时古阳早已退出警届，成了吴军团伙的骨干成员，杨震面临着危险……
在重案六组郑一民、季洁等干警的协助暇，在紧急关头将杨震救出。吴军、黄四儿两团伙被歼灭，但古阳漏网，不知去向。杨震发现吴军、黄四后面还有更深的背景……
绿云宾馆一少女死亡，季洁发现是被人强制过量注射毒品，调查幕后真相，原来吸毒女及其男友为一个贩毒团伙长期贩运毒品，准备洗手不干时被灭口。在一起重大毒品交易中六组干警将幕后真凶抓获，将贩毒团伙铲除。
重案六组第二部第2集剧情介绍古阳在逃窜途中被抓获，审讯中杨震摸出吴军、黄四儿后面更大的犯罪集团是海达贸易公司。
重案六组成立专案组对海达犯罪集团进行秘密监控和调查，同时由季洁负责对受害者进行暗中查访，不料受害人因惧怕海达的威胁，不敢与警方合作。
在六组干警的不懈努力下，案情渐渐有了突破。海达集团贩运的一批枪支，被中途截获，专案组展开行动，对海达集团全面搜捕。
重案六组第二部海报
杨震巧用计谋将逃窜中的主犯赵飞和刘一达抓获，海达犯罪集团被彻底击破。
路边遗弃一辆高级轿车，随后车主郝蓉的尸体也被发现，原来单身而富有的郝蓉勾引小区的保安魏军，随后又另寻新欢甩掉魏军，魏军起了杀心。
重案六组第二部第3集剧情介绍刚出差回来的杨震和常保乐一进办公室就听到噩耗，市局巡警大队两名巡警马志刚和周立民在设卡盘查时被犯罪嫌疑人枪击牺牲，牺牲的两名警员正好又是常保乐在警官大学时期的同学。
怀着战友牺牲的强烈悲痛，六组干警全力投入侦破。追查中杨震身负重伤，忍着伤痛的杨震终于在外地将凶犯堵截在屋顶平台上，二人持枪对峙，展开一场勇气与毅力的较量。
福达小区发生凶杀，季洁发现藏匿多年的系列强奸幼女案的凶手马洪升再次出现。
受害人佳佳目睹母亲被害，受到强烈刺激，多次自杀未遂，季洁找到当年的受害者小雪，一同解开了佳佳的心结。
凶手再次作案，却行踪不定，为了更多的无辜少女不受伤害，季洁陷入焦虑……
重案六组第二部第4集剧情介绍为了引出强奸幼女案的凶手马洪升，季洁破釜沉舟，亲自到电视台将案件在媒体曝光，这不但发动起了人民群众的力量，也引起了各级领导的，案件势在必破。
丁箭、常保乐在马洪升作案地区化妆侦察，不料遇上罪犯拦路抢劫。
丁箭勇擒罪犯，虽然暴露身份，但案件不分大小，解救人民与危难才是警察的职责。
媒体的曝光令马洪升无藏身之地、情急之下马洪升潜入季洁住处，将暂住在季洁家的小雪扣为人质，季洁与马洪升展开搏斗，危险关头杨震赶到，将马洪升制服。
